Το νησί επισκέπτονται και πολλά επιδημικά είδη. Τα πιο γνωστά είδη είναι οι μεσογειακοί ασημόγλαροι και οι κορμοράνοι, τους οποίους συναντά κανείς στα λιμάνια και γύρω από τα αλιευτικά. Εύκολα μπορεί κανείς να δει (ή σίγουρα να ακούσει) γκιώνη, διάφορα είδη αετών, μαυροπετρίτη, σταχτοτσικιά, κιρκινέζι, γεράκι, καθώς και μελισσοφάγο και αλκυόνη. Οι επισκέπτες δεν είναι, επίσης, απίθανο να απαντήσουν παγώνια, τα οποία πριν κάποια χρόνια ανήκαν στα οικόσιτα ζώα.

 

   Οι πρώτοι κάτοικοι του νησιού ασχολήθηκαν με την κτηνοτροφία, με αποτέλεσμα η Σκόπελος να είναι γνωστή για τα αμνοερίφιά της. Συγκεκριμένα, το νησί είναι φημισμένο για το γλωσσώτικο πρόβατο και τη «γίδα σκοπέλου», δύο ράτσες που θεωρούνται από τις καλύτερες στο είδος τους. Μάλιστα στα Γκιούρα, ένα ερημονήσι ανατολικά της Αλοννήσου, ανακαλύφθηκε μια σπάνια ράτσα κατσίκας. Στο νησί υπάρχουν, επίσης, λαγοί, αν και σπάνια τους συναντά πια κανείς.