Με τα οργανωμένα λιμάνια και μαρίνες της χώρας, του Λουτρακίου και του Έλιους, καθώς και τους απάνεμους κόλπους του Αγνώντα και του Πάνορμου, η Σκόπελος αποτελεί πόλο έλξης για τους ιστιοπλόους όλων των επιπέδων, από αρχάριους έως πρωταθλητές. Επίσης, διατίθενται προς ενοικίαση και καγιάκ. Οι λιγότερο «αθλητικοί», μπορούν να μισθώσουν βάρκες, ταχύπλοα σκάφη ή να κάνουν τον γύρο του νησιού με κάποιο από τα πολλά καΐκια που διοργανώνουν ολοήμερες εκδρομές.